Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HPS3Q969F9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms