Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNPO1Q92973 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNPO1Q92973 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms