Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHF3Q92576 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHF3Q92576 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms