Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SPTSSBQ8NFR3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms