Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BHLHE23Q8NDY6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHE23Q8NDY6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms