Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATG16L2Q8NAA4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms