Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYB561D1Q8N8Q1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms