Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKAP1Q86WV1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms