Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHA9Q7RTU4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms