Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SV2AQ7L0J3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms