Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PPP1R3FQ6ZSY5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3FQ6ZSY5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms