Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM88Q6PEY1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms