Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms