Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NHSL1Q5SYE7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms