Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COLEC12Q5KU26 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COLEC12Q5KU26 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms