Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR44Q5JSH3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR44Q5JSH3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms