Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D3Q587I9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms