Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C4orf17Q53FE4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4orf17Q53FE4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms