Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSNAXIP1Q2TAA8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNAXIP1Q2TAA8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms