Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NDUFA9Q16795 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NDUFA9Q16795 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms