Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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