Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATXN8Q156A1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms