Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms