Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SF1Q15637 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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