Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP1Q15431 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP1Q15431 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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