Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPAQ15257 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPAQ15257 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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