Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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