Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NR1D2Q14995 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms