Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMCO1Q147U7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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