Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SEMA3AQ14563 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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