Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SPIDRQ14159 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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SPIDRQ14159 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPIDRQ14159 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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