Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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TUBA3CQ13748 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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TUBA3CQ13748 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TUBA3CQ13748 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBA3CQ13748 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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