Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSTA3Q13630 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms