Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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CUL4AQ13619 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
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CUL4AQ13619 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CUL4AQ13619 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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CUL4AQ13619 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CUL4AQ13619 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CUL4AQ13619 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
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