Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN4PQ13434 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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