Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSLNQ13421 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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