Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE3BQ13370 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE3BQ13370 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms