Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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ITGB3BPQ13352 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB3BPQ13352 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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