Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 21.8
PABPC4Q13310 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-11■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-11■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.571e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 516.52■□□□□ 0.241e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 H2AFY-205ENST00000451949 1744 ntTSL 210.98□□□□□ -0.651e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 H2AFY-218ENST00000512507 10982 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.771e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.197e-44■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.917e-44■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.797e-44■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.617e-44■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 SRP72-204ENST00000507126 2181 ntTSL 1 (best)3.9□□□□□ -1.794e-7■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 RPS6KA1-206ENST00000438977 639 ntTSL 311.38□□□□□ -0.599e-7■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 PLP2-202ENST00000376327 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.196e-11■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 PKN1-208ENST00000586900 550 ntTSL 314.53□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 511.45□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 36.43□□□□□ -1.386e-7■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)5.69□□□□□ -1.56e-7■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.653e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-8■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.28□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 RPL36-206ENST00000582380 542 ntTSL 521.41■■□□□ 1.021e-323■■■■□ 21.7
PABPC4Q13310 METRN-206ENST00000570132 503 ntTSL 324.42■■□□□ 1.53e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PRR11-203ENST00000578542 2334 ntTSL 513.13□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)7.48□□□□□ -1.211e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.089e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-87■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-87■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAX-206ENST00000394606 2097 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAX-202ENST00000284165 3155 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-209ENST00000463529 1144 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-215ENST00000474671 917 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-216ENST00000477997 938 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-212ENST00000470062 784 ntTSL 313.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-211ENST00000470059 1012 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-214ENST00000473764 1428 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-210ENST00000465859 812 ntTSL 210.4□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PQBP1-208ENST00000456306 451 ntTSL 38.09□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-204ENST00000475947 598 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-38■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 S100A13-202ENST00000392622 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 XRCC5-209ENST00000485763 616 ntTSL 28.18□□□□□ -1.17e-12■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.397e-12■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 CD320-206ENST00000599573 861 ntTSL 220.98■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.952e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 FBXW5-206ENST00000483559 2392 ntTSL 229.48■■■□□ 2.318e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 FBXW5-204ENST00000459905 2339 ntTSL 228.02■■■□□ 2.088e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.818e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 RPS10-205ENST00000480942 734 ntTSL 212.96□□□□□ -0.333e-76■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.639e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.156e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.86e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.766e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 319.62■□□□□ 0.736e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.66e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NDUFA13-206ENST00000511584 640 ntTSL 217.63■□□□□ 0.411e-9■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.043e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.381e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 TRIM27-203ENST00000414543 1813 ntTSL 311.55□□□□□ -0.561e-8■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PPP2R5D-203ENST00000461010 1558 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.38e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.738e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.148e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.165e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.165e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 HGH1-205ENST00000533266 2106 ntTSL 224.05■■□□□ 1.449e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.189e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 HGH1-206ENST00000534255 1791 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.689e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.239e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-227ENST00000641811 1031 nt20.66■□□□□ 0.99e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.869e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-230ENST00000641927 1678 nt20.19■□□□□ 0.829e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-226ENST00000641756 2132 nt19.85■□□□□ 0.779e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.679e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-211ENST00000641213 2053 nt18.89■□□□□ 0.629e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 21.6
PABPC4Q13310 PHGDH-229ENST00000641891 2175 nt18.82■□□□□ 0.69e-7■■■■□ 21.6
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 199.9 ms