Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GPS1Q13098 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GPS1Q13098 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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