Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRJQ12913 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRJQ12913 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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