Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RIPPLY1Q0D2K3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms