Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNB2Q08289 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB2Q08289 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms