Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAV1Q03135 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAV1Q03135 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms