Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSG9Q00887 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSG9Q00887 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSG9Q00887 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSG9Q00887 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSG9Q00887 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms