Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCCQ00597 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCCQ00597 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms