Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDLBPQ00341 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDLBPQ00341 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms