Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms