Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL20P78556 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL20P78556 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL20P78556 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL20P78556 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms