Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASIC1P78348 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms